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行业动态百健裁员830人图转型进

 

MolecularCell:CRISPR再现三种基因组编辑新蛋白

来自于NCBI、麻省理工学院、罗格斯大学的研究者今日将该研究成果发表在MolecularCell上,他们发现三种新蛋白C2c1、C2c2、C2c3是已知用于人类基因组编辑的CRISPR系统的远亲,该发现说明存在CRISPR系统新类型。

上月,以FengZhang为首的一群来自麻省理工学院和Broad研究所的科学家揭示了CRISPR/Cpf1特征,它是一种新的单-RNA导向CRISPR系统,可编辑人体细胞的DNA分子。

2型CRISPR系统的特征是CRISPR-associated(Cas)蛋白较大(1型系统的Cas蛋白较小)。科学家通过微生物基因组数据库大数据分析找到基因组的53个位点存在C2c1,C2c2,C2c3标签。

此外,在芽孢杆菌门,疣微菌门、ɑ-变形菌门、δ-变形菌门的18个种中均发现C2c1蛋白,其作用机制类似于Cas9——能转化为双-RNA引导人体细胞中DNA核酸内切酶的活性。类似Cpf1,C2c1也需要一种被称为“PAM”(protospaceradjacentmotif)的短DNA序列来实现其在基因组T丰富区域的编辑能力。同时,研究者可将两个RNA分子合并成为单-引导RNA,使其和CRISPR/Cas9一样进行基因组编辑。C2c3和C2c1亲缘关系较远,且暂不能被细分到一个特定的分类单元,但二者和Cpf1一样都具有RuvC-like核酸区域。然而C2c2与Cas9,Cpf1及其他两个新发现的蛋白均没有序列相似性,这一点和其他所有2型蛋白不同。研究者称在ɑ-变形菌门、芽孢杆菌纲、梭菌纲、梭杆菌纲及拟杆菌纲中的21个细菌种中均发现C2c2蛋白。另外,研究者预测C2c2和两个crRNAs相关,但最终仅仅找到一个。进一步对C2c2的序列进行研究发现它存在高等真核生物和原核生物核苷酸结合域(HEPN),表明其可能具有RNase或RNA裂解活性。其他暂未用于基因组编辑的CRISPR系统类型已经被证明可靶向裂解RNA,C2c2是2类CRISPR系统中发现的第一个有此功能的蛋白。来源:GenomeWeb

Nature:惊人发现——大脑一般的细菌

加州大学圣迭戈分校的科学家们发现,细菌相互通讯的机制与人类大脑非常相似。这项研究发表在十月二十一日的Nature杂志上。该发现表明,细菌通过大脑神经元信号传导类似的离子通道进行通讯,并由此解决自己的代谢压力。由此可见,代谢压力触发的神经疾病可能具有古老的细菌渊源,人们可以从一个新角度来看这类疾病的治疗。”

研究人员发现,当枯草芽孢杆菌组成的生物膜生长到一定大小的时候,保护性的边缘细菌会周期性地停止生长,以便营养物质(尤其是谷氨酸)流入生物膜的中心地带。正因如此,中心地带受到保护的细菌既可以生存下来,又能够抵抗化合物和抗生素。值得注意的是,人类大脑活动有一半是谷氨酸驱动的。研究人员认为,生物膜中远距离细菌之间的代谢调节可能涉及了电化学通讯。于是他们在生物膜的代谢振荡中监测了细菌细胞膜电位的改变。研究显示,膜电位的改变与生物膜的生长振荡相符,而且膜电位改变是离子通道介导的。进一步研究表明,生物膜的远距离电信号传导是通过钾离子实施的,钾离子扩散波协调着内部和外部细菌的代谢活性。去除细菌的钾离子通道,生物膜的电信号传导就无法进行。

研究指出,这种细菌通讯机制与人类大脑的“皮层扩散性抑制”惊人的相似,而皮层扩散性抑制被认为与偏头疼和癫痫有关。来源:生物探索

临床动态

23andMe回归基因测序,美元提供新服务

本周三,23andMe正式宣布回归,再次提供直接面向消费者的基因测试服务,且已获得FDA批准。23andMe此次提供修订后的个性化基因组服务,包括祖源、健康、非医学特征(如雀斑、头发卷曲、乳糖不耐受症等)以及疾病携带状况的信息报告。这项新服务价格为美元,帮助消费者判断是否携带一些与遗传性疾病相关的基因突变,这些疾病包括囊纤维化、家族黑蒙性白痴以及镰状细胞贫血。

与之前不同,这次23andMe不给消费者提供疾病风险的实时信息,而是







































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